Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L2Q9NZM6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L2Q9NZM6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms