Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A1Q9NY26 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms