Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms