Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MKS1Q9NXB0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms