Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms