Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms