Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPMQ9NSP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPMQ9NSP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPMQ9NSP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms