Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO6Q9NRD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms