Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ITM2CQ9NQX7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITM2CQ9NQX7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2CQ9NQX7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms