Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIT2Q9NQR4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIT2Q9NQR4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIT2Q9NQR4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIT2Q9NQR4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIT2Q9NQR4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms