Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEPEQ9NQ76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms