Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSU72Q9NP77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSU72Q9NP77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms