Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRMS1Q9HCU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms