Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XAB2Q9HCS7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms