Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF556Q9HAH1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF556Q9HAH1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms