Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SCAF1Q9H7N4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAF1Q9H7N4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF1Q9H7N4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms