Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf33Q9H7E9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf33Q9H7E9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms