Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCQ9H7C4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCQ9H7C4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCQ9H7C4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms