Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf42Q9H799 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms