Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC86Q9H6F5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC86Q9H6F5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC86Q9H6F5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms