Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF3Q9H4W6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF3Q9H4W6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF3Q9H4W6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBF3Q9H4W6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBF3Q9H4W6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF3Q9H4W6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms