Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM12Q9H4Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM12Q9H4Q4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM12Q9H4Q4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms