Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4AQ9H3S1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4AQ9H3S1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms