Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNMDQ9H2S6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNMDQ9H2S6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNMDQ9H2S6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms