Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG10Q9H0Y0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG10Q9H0Y0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms