Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LNPKQ9C0E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LNPKQ9C0E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms