Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM208Q9BTX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM208Q9BTX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms