Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms