Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT3Q9BQG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms