Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOPXQ9BPY8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms