Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSG101Q99816 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSG101Q99816 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms