Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC6Q99741 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC6Q99741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms