Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRQ99707 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRQ99707 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRQ99707 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRQ99707 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRQ99707 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRQ99707 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRQ99707 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTRQ99707 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRQ99707 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRQ99707 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRQ99707 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRQ99707 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRQ99707 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRQ99707 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRQ99707 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRQ99707 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRQ99707 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRQ99707 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRQ99707 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRQ99707 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRQ99707 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRQ99707 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRQ99707 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTRQ99707 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTRQ99707 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRQ99707 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms