Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3RQ99062 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1337.7 ms