Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX18Q96RF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX18Q96RF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX18Q96RF0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms