Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNT1Q96Q11 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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