Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms