Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms