Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC138Q96M89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC138Q96M89 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms