Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC7Q96M83 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC7Q96M83 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms