Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC114Q96M63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms