Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZC2HC1AQ96GY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms