Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms