Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINGO1Q96FE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms