Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms