Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDL1Q96EA4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms