Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A6EQ96DS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A6EQ96DS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms