Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HVCN1Q96D96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HVCN1Q96D96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HVCN1Q96D96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms