Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUNDC1Q96C34 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms