Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H4Q92791 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H4Q92791 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms