Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBXN4Q92575 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms